Protein–RNA interactions for Protein: P03899

Mtnd3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd3P03899 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtnd3P03899 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtnd3P03899 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms