Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01851 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01851 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01851 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01851 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01851 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01851 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01851 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01851 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01851 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01851 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01851 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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