Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01679 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01679 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01679 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms