Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01660 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01660 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01660 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01660 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01660 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01660 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01660 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms