Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01629 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01629 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01629 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01629 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01629 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01629 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01629 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01629 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01629 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01629 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01629 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01629 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01629 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms