Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms