Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ShdO88834 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ShdO88834 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ShdO88834 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ShdO88834 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ShdO88834 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ShdO88834 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ShdO88834 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ShdO88834 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms