Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JtbO88824 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
JtbO88824 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
JtbO88824 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
JtbO88824 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
JtbO88824 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JtbO88824 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms