Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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F11rO88792 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
F11rO88792 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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F11rO88792 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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F11rO88792 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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F11rO88792 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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F11rO88792 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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F11rO88792 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
F11rO88792 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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F11rO88792 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F11rO88792 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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