Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms