Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klc1O88447 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms