Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms