Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfdp1O88271 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfdp1O88271 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfdp1O88271 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfdp1O88271 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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