Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CaskO70589 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CaskO70589 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CaskO70589 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CaskO70589 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CaskO70589 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CaskO70589 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CaskO70589 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CaskO70589 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms