Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna4O70174 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms