Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldb2O55203 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms