Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrxO55103 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PrxO55103 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PrxO55103 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrxO55103 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrxO55103 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrxO55103 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrxO55103 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms