Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1bO55017 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms