Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlkO54988 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SlkO54988 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SlkO54988 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SlkO54988 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SlkO54988 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SlkO54988 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlkO54988 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlkO54988 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SlkO54988 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms