Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms