Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms