Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EdaO54693 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EdaO54693 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EdaO54693 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EdaO54693 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EdaO54693 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EdaO54693 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EdaO54693 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms