Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Sdc4O35988 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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