Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nek2O35942 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms