Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NudcO35685 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NudcO35685 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NudcO35685 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NudcO35685 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NudcO35685 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NudcO35685 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NudcO35685 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NudcO35685 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NudcO35685 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms