Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pold2O35654 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms