Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd2O35392 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd2O35392 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms