Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms