Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CenpaO35216 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms