Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms