Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Alx4O35137 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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