Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ArxO35085 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ArxO35085 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ArxO35085 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ArxO35085 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ArxO35085 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ArxO35085 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ArxO35085 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ArxO35085 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ArxO35085 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms