Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa3O09000 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms