Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hps1O08983 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms