Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
U90926O08546 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
U90926O08546 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
U90926O08546 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
U90926O08546 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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