Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3239L7N2D9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3239L7N2D9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3239L7N2D9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3239L7N2D9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3239L7N2D9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3239L7N2D9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3239L7N2D9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm3239L7N2D9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3239L7N2D9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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