Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm6871L7N248 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm6871L7N248 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm6871L7N248 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm6871L7N248 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6871L7N248 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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