Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms