Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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