Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms