Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem200cJ3QK46 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem200cJ3QK46 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms