Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21411J3KMS0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms