Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm20830J3KML6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm20830J3KML6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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