Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms