Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms