Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc4lG5E8X2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms