Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r176G3UW31 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms