Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms