Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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