Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5798F7BTS7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm5798F7BTS7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm5798F7BTS7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms